Được thành lập vào tháng 11 năm 2013, Ams Baking Club là câu lạc bộ làm bánh dành cho những tín đồ của ẩm thực, đặc biệt là những ai yêu bánh và có đam mê với nghệ thuật làm bếp. Thật vậy, là một câu lạc bộ ẩm thực duy nhất ở trong trường, Ams Baking Club (ABC) vẫn luôn là một sân chơi cho tất cả các học sinh trên địa bàn thành phố Hà Nội
GHA – Green Hanoi Amsterdam là một câu lạc bộ môi trường và xã hội hàng đầu trường Ams được thành lập vào năm 2009. Khởi đầu là một tổ chức học sinh về môi trường đầu tiên tại Hà Nội, sau nhiều năm hoạt động, lĩnh vực mà GHA theo đuổi ngày càng được mở rộng, với rất nhiều các chương trình về xã hội. GHA ghi dấu ấn của mình với nhiều sự kiện nổi bật như: Greenlife, Tết Ấm Áp, Code of Culture, Camp Blast. Đến với GHA, các em sẽ được làm việc trong một môi trường chuyên nghiệp và trên hết, các em sẽ có một đại gia đình nhiều thế hệ, đầy yêu thương và vô cùng đoàn kết.
Câu lạc bộ Văn hóa Việt – Nhật trường THPT chuyên Hà Nội – Amsterdam là câu lạc bộ duy nhất của THPT Hà Nội – Amsterdam về văn hóa Nhật Bản, HAJV luôn giữ một vị trí đặc biệt trong trường nói riêng và trong thành phố Hà Nội nói chung. Khởi đầu từ số lượng thành viên ít ỏi, hiện tại HAJV đã trải qua năm, đạt tới gần 200 thành viên cũng như dựng nên rất nhiều hoạt động ngoại khóa bổ ích và thú vị. Không chỉ dừng ở một câu lạc bộ trao đổi và giao lưu văn hóa Nhật Bản, HAJV còn là ngôi nhà thứ 2 của nhiều cựu và các học sinh trường HN – Amsterdam.
Hanoi – Amsterdam Korean Culture Club (HAKC) là Câu lạc bộ Văn hoá Việt – Hàn đầu tiên và duy nhất tại trường THPT chuyên Hà Nội – Amsterdam. Nhận thấy Văn hóa Hàn Quốc và làn sóng Hallyu đang ngày càng phổ biến trên toàn thế giới, CLB Văn hóa Việt-Hàn HAKC mong muốn sẽ là nơi dành cho các bạn học sinh có chung niềm đam mê với K-Culture cùng nhau giao lưu và chia sẻ kiến thức giữa hai nền văn hóa Việt-Hàn trong thời buổi hội nhập và toàn cầu hóa.
Humans of Hanoi – Amsterdam High School (HoHA), là CLB nghệ thuật và xã hội được thành lập vào năm 2014. Lấy format theo Humans of New York, HoHA mong muốn đem đến cho những người theo dõi góc nhìn mới và sâu sắc hơn về Ams và con người ở Ams, thông qua chính những câu chuyện chân thực của những người đã, đang, và sẽ luôn là một phần của mái trường Hanoi – Amsterdam.